Kesejahteraan mahasiswa prodi Pendidikan Fisika juga mendapat perhatian. Untuk bidang kerohanian Campus Ministry menyediakan berbagai fasilitas. Mahasiswa dapat berkonsultasi, menggunakan ruang doa dan pustaka yang ada. Di kampus USD juga terdapat klinik kesehatan. Segenap mahasiswa dapat melakukan pemeriksaan kesehatan tanpa dipungut biaya. Bagi mahasiswa yang menderita sakit USD juga memberi bantuan/asuransi untuk meringankan beban mahasiswa.

Untuk membantu keuangan mahasiswa tersedia berbagai bentuk beasiswa dan bantuan keuangan dari Universitas Sanata Dharma maupun dari luar. Beasiswa tersebut antara lain Beasiswa Ijari, Beasiswa Lippo, Bantuan Khusus Sanata Dharma, Sanata Dharma Student Fund, Dana Van Lith, Bantuan Penyelesaian Tugas Akhir dan lain-lain.