Program studi Pendidikan Fisika mengelola Lab. Fisika dan Lab. Microteaching. Lab. Fisika meliputi Lab. Fisika Dasar, Lab. Elektronika dan Elektromagnetik, dan Lab. Fisika Atom dan Inti. Peralatan tersedia lengkap dari segi jenis maupun jumlahnya sehingga semua praktikum Fisika dapat diselenggarakan secara mandiri.

Peralatan tersebut juga banyak digunakan untuk penelitian tugas akhir mahasiswa dan demonstarasi dalam perkuliahan. Untuk pembelajaran pemograman komputer terdapat Lab Komputer Dasar. Untuk kepentingan penelitian mahasiswa prodi Pendidikan Fisika dapat pula menggunakan semua fasilitas di laboratorium lain di lingkungan Universitas Sanata Dharma seperti Lab. Analisa Kimia Fisika Pusat, Lab. Jur Teknik Mesin, Lab. Jur Teknik Elektro, dan Lab. Farmasi.

Perkuliahan dilakukan di ruang kuliah yang nyaman. Untuk menunjang pembelajaran disediakan perangkat multimedia seperti viewer, perlengkapan audio. Sumber pustaka tersedia lengkap di perpustakaan. Perpustakaan memiliki koleksi buku-buku teks Fisika tingkat dasar sampai lanjut, serta berbagai jurnal Fisika dan jurnal lainnya.

Hot spot yang tersedia di selasar-selasar dapat diakses secara bebas oleh semua mahasiswa. Lingkungan kampus tertata dengan baik, bersih, teduh dan asri.